Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CASQ1P31415 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms