Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms