Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEFF2Q9UIK5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms