Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FBXO40Q9UH90 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO40Q9UH90 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms