Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
IFT172Q9UG01 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms