Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms