Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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