Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms