Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms