Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms