Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMTK3Q96Q04 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms