Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC7Q96NW7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC7Q96NW7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms