Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms