Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms