Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCC1Q96CN9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCC1Q96CN9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms