Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM41Q8WV44 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM41Q8WV44 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms