Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29Q8TEQ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms