Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL11Q8NHH1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms