Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf62Q8N4C0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms