Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNL1Q8IU54 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms