Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT27Q7Z3Y8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT27Q7Z3Y8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms