Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSH2Q76I76 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms