Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms