Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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USP53Q70EK8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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USP53Q70EK8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP53Q70EK8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP53Q70EK8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP53Q70EK8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP53Q70EK8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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