Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XIRP1Q702N8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms