Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms