Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI0

OTOG, Otogelin, humanhuman

Predictions only

Length 2,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOGQ6ZRI0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTOGQ6ZRI0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTOGQ6ZRI0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms