Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRWD3Q6RI45 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRWD3Q6RI45 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms