Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms