Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms