Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A3Q5K4L6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms