Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3KQ59H18 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3KQ59H18 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms