Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP28Q4G0W2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms