Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWISTNBQ3B726 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms