Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITSN1Q15811 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms