Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM1Q15032 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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