Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC3Q14003 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNC3Q14003 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms