Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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RPA4Q13156 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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