Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRDM2Q13029 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
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