Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2AQ12879 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
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