Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFEMP1Q12805 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms