Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms