Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL16A1Q07092 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL16A1Q07092 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms