Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms