Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP1Q00587 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP1Q00587 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms