Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNRPNP63162 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms