Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERVK_113P62684 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P62684 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms