Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BACE1P56817 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BACE1P56817 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BACE1P56817 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BACE1P56817 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BACE1P56817 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BACE1P56817 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms