Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP6P55212 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP6P55212 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP6P55212 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms