Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms